MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015184	TTGCT	2	10	228888	228897	0 %	60 %	20 %	20 %	325168544
4502	NC_015184	CGG	2	6	228924	228929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168544
4503	NC_015184	TCA	2	6	229017	229022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168544
4504	NC_015184	GATG	2	8	229057	229064	25 %	25 %	50 %	0 %	325168544
4505	NC_015184	TGT	2	6	229087	229092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168544
4506	NC_015184	CGCGC	2	10	229107	229116	0 %	0 %	40 %	60 %	325168544
4507	NC_015184	GC	4	8	229113	229120	0 %	0 %	50 %	50 %	325168544
4508	NC_015184	GAC	2	6	229172	229177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168544
4509	NC_015184	ATC	2	6	229247	229252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168544
4510	NC_015184	TCA	2	6	229253	229258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168544
4511	NC_015184	GAG	2	6	229277	229282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168544
4512	NC_015184	GAC	2	6	229349	229354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168544
4513	NC_015184	CGC	2	6	229433	229438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168544
4514	NC_015184	TGC	2	6	229474	229479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168544
4515	NC_015184	CAG	2	6	229518	229523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168544
4516	NC_015184	AC	3	6	229536	229541	50 %	0 %	0 %	50 %	325168544
4517	NC_015184	GC	3	6	229636	229641	0 %	0 %	50 %	50 %	325168544
4518	NC_015184	ACTC	2	8	229664	229671	25 %	25 %	0 %	50 %	325168544
4519	NC_015184	CT	3	6	229698	229703	0 %	50 %	0 %	50 %	325168544
4520	NC_015184	AGC	2	6	229733	229738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168544
4521	NC_015184	CAG	2	6	229745	229750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168544
4522	NC_015184	GCG	2	6	229803	229808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_015184	GTG	2	6	229838	229843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015184	CAA	2	6	229900	229905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_015184	TGG	2	6	229925	229930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015184	GCC	2	6	229956	229961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_015184	TCG	2	6	230067	230072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168545
4528	NC_015184	GTC	2	6	230149	230154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168545
4529	NC_015184	TCT	2	6	230250	230255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168545
4530	NC_015184	GTTC	2	8	230274	230281	0 %	50 %	25 %	25 %	325168545
4531	NC_015184	GCC	2	6	230351	230356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168545
4532	NC_015184	CGT	2	6	230460	230465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168545
4533	NC_015184	GCG	2	6	230477	230482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168545
4534	NC_015184	TGT	2	6	230670	230675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168545
4535	NC_015184	A	6	6	230719	230724	100 %	0 %	0 %	0 %	325168545
4536	NC_015184	GC	3	6	230790	230795	0 %	0 %	50 %	50 %	325168545
4537	NC_015184	CGA	2	6	230889	230894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168545
4538	NC_015184	GTT	2	6	230923	230928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015184	TAG	2	6	230939	230944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015184	CTG	2	6	231012	231017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168546
4541	NC_015184	CAGCAC	2	12	231111	231122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325168546
4542	NC_015184	AAGG	2	8	231123	231130	50 %	0 %	50 %	0 %	325168546
4543	NC_015184	CCA	2	6	231195	231200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168546
4544	NC_015184	CGG	2	6	231221	231226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168546
4545	NC_015184	ACGC	2	8	231256	231263	25 %	0 %	25 %	50 %	325168546
4546	NC_015184	GTTC	2	8	231275	231282	0 %	50 %	25 %	25 %	325168546
4547	NC_015184	GAT	2	6	231347	231352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168546
4548	NC_015184	TCC	2	6	231383	231388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168546
4549	NC_015184	CGC	2	6	231488	231493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168546
4550	NC_015184	TCG	2	6	231527	231532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168546
4551	NC_015184	AC	3	6	231552	231557	50 %	0 %	0 %	50 %	325168546
4552	NC_015184	GGC	3	9	231625	231633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168546
4553	NC_015184	GCG	2	6	231670	231675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168546
4554	NC_015184	AAG	2	6	231741	231746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168546
4555	NC_015184	AAC	2	6	231755	231760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168546
4556	NC_015184	AGT	2	6	231793	231798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015184	GCA	2	6	231826	231831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168547
4558	NC_015184	CTA	2	6	231853	231858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168547
4559	NC_015184	CGT	2	6	231875	231880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168547
4560	NC_015184	AG	3	6	231930	231935	50 %	0 %	50 %	0 %	325168547
4561	NC_015184	C	6	6	231968	231973	0 %	0 %	0 %	100 %	325168547
4562	NC_015184	ATCA	2	8	231979	231986	50 %	25 %	0 %	25 %	325168547
4563	NC_015184	CGA	2	6	232205	232210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168548
4564	NC_015184	CAG	2	6	232255	232260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168548
4565	NC_015184	CGTG	2	8	232289	232296	0 %	25 %	50 %	25 %	325168548
4566	NC_015184	GGC	2	6	232326	232331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168548
4567	NC_015184	TCGCC	2	10	232353	232362	0 %	20 %	20 %	60 %	325168548
4568	NC_015184	ATC	2	6	232448	232453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168549
4569	NC_015184	ATG	2	6	232455	232460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168549
4570	NC_015184	AG	3	6	232514	232519	50 %	0 %	50 %	0 %	325168549
4571	NC_015184	AGC	2	6	232543	232548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168549
4572	NC_015184	TACT	2	8	232647	232654	25 %	50 %	0 %	25 %	325168549
4573	NC_015184	GCA	2	6	232712	232717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168549
4574	NC_015184	ACGC	2	8	232742	232749	25 %	0 %	25 %	50 %	325168549
4575	NC_015184	CGT	2	6	232818	232823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168550
4576	NC_015184	CGT	2	6	232829	232834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168550
4577	NC_015184	TCAC	2	8	232862	232869	25 %	25 %	0 %	50 %	325168550
4578	NC_015184	GCC	2	6	232880	232885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168550
4579	NC_015184	ATG	2	6	232913	232918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168550
4580	NC_015184	CGG	2	6	232944	232949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168550
4581	NC_015184	AGA	2	6	232995	233000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168550
4582	NC_015184	GTC	2	6	233056	233061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168551
4583	NC_015184	GCG	2	6	233167	233172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168551
4584	NC_015184	AG	3	6	233191	233196	50 %	0 %	50 %	0 %	325168551
4585	NC_015184	CGC	2	6	233215	233220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168551
4586	NC_015184	AG	3	6	233265	233270	50 %	0 %	50 %	0 %	325168551
4587	NC_015184	CTT	2	6	233288	233293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168551
4588	NC_015184	GAT	2	6	233297	233302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168551
4589	NC_015184	CGTCC	2	10	233432	233441	0 %	20 %	20 %	60 %	325168551
4590	NC_015184	TGT	2	6	233483	233488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168551
4591	NC_015184	GGA	2	6	233503	233508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168551
4592	NC_015184	ATC	2	6	233516	233521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168551
4593	NC_015184	GAG	2	6	233603	233608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168551
4594	NC_015184	AGA	2	6	233615	233620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168551
4595	NC_015184	TGAT	2	8	233628	233635	25 %	50 %	25 %	0 %	325168551
4596	NC_015184	TCA	2	6	233674	233679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168551
4597	NC_015184	AGCT	2	8	233716	233723	25 %	25 %	25 %	25 %	325168552
4598	NC_015184	AGAATG	2	12	233817	233828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	325168552
4599	NC_015184	CAC	2	6	233959	233964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_015184	ATAC	2	8	233986	233993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_015184	CAG	2	6	234015	234020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_015184	GCG	2	6	234086	234091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015184	TTC	2	6	234095	234100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015184	CTA	2	6	234112	234117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_015184	GC	4	8	234152	234159	0 %	0 %	50 %	50 %	325168553
4606	NC_015184	CGC	2	6	234204	234209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168553
4607	NC_015184	GCC	2	6	234212	234217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168553
4608	NC_015184	A	6	6	234278	234283	100 %	0 %	0 %	0 %	325168553
4609	NC_015184	GAA	2	6	234301	234306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168553
4610	NC_015184	CG	3	6	234312	234317	0 %	0 %	50 %	50 %	325168553
4611	NC_015184	TGC	2	6	234352	234357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168553
4612	NC_015184	GCGCC	2	10	234411	234420	0 %	0 %	40 %	60 %	325168553
4613	NC_015184	TCG	3	9	234422	234430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168553
4614	NC_015184	AT	3	6	234431	234436	50 %	50 %	0 %	0 %	325168553
4615	NC_015184	GAT	2	6	234475	234480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168553
4616	NC_015184	GA	3	6	234492	234497	50 %	0 %	50 %	0 %	325168553
4617	NC_015184	AGC	2	6	234569	234574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168553
4618	NC_015184	CCGA	2	8	234644	234651	25 %	0 %	25 %	50 %	325168553
4619	NC_015184	CGC	2	6	234766	234771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168553
4620	NC_015184	GCA	2	6	234774	234779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168553
4621	NC_015184	GCT	2	6	234780	234785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168553
4622	NC_015184	CGGG	2	8	234945	234952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4623	NC_015184	CTT	2	6	234975	234980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_015184	CG	3	6	235055	235060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4625	NC_015184	CTT	2	6	235102	235107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_015184	ACGTC	2	10	235179	235188	20 %	20 %	20 %	40 %	325168554
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4628	NC_015184	GCT	2	6	235264	235269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168554
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4632	NC_015184	GC	3	6	235550	235555	0 %	0 %	50 %	50 %	325168554
4633	NC_015184	CTG	2	6	235595	235600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168554
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4642	NC_015184	GCAG	2	8	235942	235949	25 %	0 %	50 %	25 %	325168554
4643	NC_015184	ACG	2	6	235968	235973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168554
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4652	NC_015184	CTG	2	6	236480	236485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168555
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4656	NC_015184	CG	3	6	236616	236621	0 %	0 %	50 %	50 %	325168555
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4743	NC_015184	CGG	2	6	241603	241608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168564
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4747	NC_015184	G	7	7	241779	241785	0 %	0 %	100 %	0 %	325168564
4748	NC_015184	ACG	2	6	241807	241812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168564
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4751	NC_015184	ATTG	2	8	241863	241870	25 %	50 %	25 %	0 %	325168564
4752	NC_015184	CAG	2	6	241934	241939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168564
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4782	NC_015184	CTG	2	6	243640	243645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4872	NC_015184	GAG	2	6	248960	248965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168571
4873	NC_015184	CAT	2	6	249031	249036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168571
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4875	NC_015184	CAAGCG	2	12	249121	249132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168571
4876	NC_015184	GAT	2	6	249133	249138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168571
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4878	NC_015184	CTG	2	6	249170	249175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168571
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4893	NC_015184	TGC	2	6	249845	249850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168572
4894	NC_015184	AG	3	6	249860	249865	50 %	0 %	50 %	0 %	325168572
4895	NC_015184	GC	4	8	249867	249874	0 %	0 %	50 %	50 %	325168572
4896	NC_015184	CGT	2	6	249884	249889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168572
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4899	NC_015184	GTC	2	6	250194	250199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168572
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4903	NC_015184	TCA	2	6	250434	250439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168573
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4910	NC_015184	GCACAT	2	12	250846	250857	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325168573
4911	NC_015184	C	6	6	250880	250885	0 %	0 %	0 %	100 %	325168573
4912	NC_015184	CATC	2	8	250969	250976	25 %	25 %	0 %	50 %	325168574
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4943	NC_015184	CG	3	6	252659	252664	0 %	0 %	50 %	50 %	325168576
4944	NC_015184	CGTC	2	8	252673	252680	0 %	25 %	25 %	50 %	325168576
4945	NC_015184	GAC	2	6	252742	252747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168576
4946	NC_015184	GTC	2	6	252761	252766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168576
4947	NC_015184	CGAT	2	8	252866	252873	25 %	25 %	25 %	25 %	325168576
4948	NC_015184	ACCA	2	8	252907	252914	50 %	0 %	0 %	50 %	325168576
4949	NC_015184	CGG	2	6	252933	252938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168576
4950	NC_015184	GATC	2	8	252945	252952	25 %	25 %	25 %	25 %	325168576
4951	NC_015184	GAT	2	6	253014	253019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168576
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4955	NC_015184	TGGC	2	8	253335	253342	0 %	25 %	50 %	25 %	325168576
4956	NC_015184	CGA	2	6	253377	253382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168576
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4969	NC_015184	GA	3	6	254086	254091	50 %	0 %	50 %	0 %	325168577
4970	NC_015184	GAT	2	6	254102	254107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168577
4971	NC_015184	ATGG	2	8	254153	254160	25 %	25 %	50 %	0 %	325168577
4972	NC_015184	AAG	2	6	254172	254177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168577
4973	NC_015184	AAC	2	6	254281	254286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168577
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4975	NC_015184	CAT	2	6	254369	254374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4980	NC_015184	GCC	2	6	254853	254858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168578
4981	NC_015184	CAG	2	6	254883	254888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168578
4982	NC_015184	GCA	2	6	254889	254894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168578
4983	NC_015184	GAA	2	6	254901	254906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168578
4984	NC_015184	GAA	2	6	254922	254927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168578
4985	NC_015184	CAC	2	6	254930	254935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168578
4986	NC_015184	CCA	2	6	254950	254955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168578
4987	NC_015184	GC	4	8	254957	254964	0 %	0 %	50 %	50 %	325168578
4988	NC_015184	AGG	2	6	254965	254970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168578
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4992	NC_015184	CGA	2	6	255098	255103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168578
4993	NC_015184	CTT	2	6	255123	255128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168578
4994	NC_015184	CGT	2	6	255185	255190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168578
4995	NC_015184	CAC	2	6	255257	255262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168578
4996	NC_015184	GCA	2	6	255278	255283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168578
4997	NC_015184	TGG	2	6	255295	255300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168578
4998	NC_015184	CGA	2	6	255322	255327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168578
4999	NC_015184	CGT	2	6	255359	255364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168578
5000	NC_015184	TCC	2	6	255393	255398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168578

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